Утилита идет в комплекте в Убунту. Позволяет просто из скрипта вывести в интерфейс сообщения и вопросы. Пример использования:

#!/bin/bash

zenity --question --text="Действительно выключить компьютер?" 

if [[ $? -eq "0" ]]
then
    /sbin/shutdown -h now
else
  exit 1
fi

Статья на Хабре про использование zenity: тут.