http://www.levinkv.ru/linux/osnovnyie-komandyi-linux/arhivatsiya-v-linux.html
Заархивировать с паролем: zip -9 -P fatherfrost778 /tmp/mysql-dump.zip /tmp/mysql-dump.sql

Запаковать текущую папку с подпапками в zip-архив folder.zip
zip -r folder.zip ./

-j - не записывать пути директорий